La Unidad de Producción y Control de Calidad es el órgano lineal de tercer nivel organizacional, en cuanto a Producción su función principal es velar por el proceso de captación de agua superficial así­ como de su potabilización bajo parámetros de calidad para el consumo humano. En cuanto a Control de Calidad su función consiste en planear, coordinar y evaluar el control de calidad de agua potable en concordancia con las normas, monitoreando que se encuentren dentro de los estándares de calidad y de los límites máximos permisibles para el consumo humano. Asimismo, supervisa y evalúa la aplicación de las normas vigentes sobre el control sanitario para el tratamiento de agua potable. 

Está a cargo de un responsable y depende jerárquicamente de la Gerencia Técnica.